En el caso de las niñas se desconoce el origen de la activación prematura de las hormonas sexuales (gonadotrofinas), mientras en los varones es asociado a procesos orgánicos.
Se cree que la presencia de tumores en el sistema nervioso central o el hipotálamo son los que ocasionan en los varones la pubertad precoz, también infecciones como meningitis o traumatismos.
Sin bien los signos físicos como el crecimiento de las mamas o el desarrollo testicular caracterizan la pubertad precoz, muchos niños tienen inquietudes sexuales antes cumplir los 8 años, lo cual es hasta cierto punto normal, pero en ocasiones se ve reforzada por la influencia de terceros y la mínima presencia de los padres para aconsejarlos.